Di Indonesia,data tentang fenotipe virus AI subtipe H5N1 sangat terbatas, dikeranaken fasilitas yangdigunakan untuk pengujian tersebut harus di labolatorium berkeamanan tingkat III(biosafety level III). Selain itu virus influenza memiliki tingkat kesalahan yang tinggi selama transkripsi genom mereka karena mempunyai RNA polimerase yang rendah.