Nitrifikasi merupakan reaksi penting dalam siklus nitrogen, yaitu oksidasi amonium menjadi nitrit dan oksidasi nitrit menjadi nitrat. Nitrifikasi autotrofik dilakukan oleh dua kelompok bakteri kemolitotrofik yang berbeda yaitu ammonia-oxidizing bacteria (AOB) seperti Nitrosoamanas dan nitrite-oxidizing bacteria (NOB0 seperti Nitrobacter.