Text
Genetic diversity of Indonesian bacterial leaf blight isolate (xanthomonas oryzae pv. oryzae) core collection based on the VNTR and avrXa7 molecular markers.
Keragaman genetika core collection isolat bacterial leaf (xanthomonas oryzaepv. oryzae) Indonesia berdasarkan marka Molekular VNTR dan avrX7. Bacterial leaf blight (BLB) adalah salah satu penyakit utama padi yang disebabkan oleh bakteri pathogen Xanthomonas oryzae pv. oryzae. Penelitian ini bertujuan untuk mengidentifikasi dan menganalisis keragaman genetik 18 isolat isolates yang terdiri dari 7 ras dan 11 haplotipe yang berasal dari beberapa lokasi koleksi di Indonesia . Analisi keragaman genetik dilakukan menggunakan marka VNTR (Variabel Number of Tandem Repeat) dan marka gen avrxa7. Pola pita DNA hasil amplifikasi digunakan sebagai data input biner untuk membuat dendogram keragaman. Berdasarkan dendogram tersebut, terdapat tiga kelompok genotipe X. oryzae pv. oryzae dengan tingkat virulensi yang berbeda. Ras VII (IXO80_021) yang termasuk dalam kelompok I dan Ras VIII-A (IXO 80_024) yang termasuk dalam kelompok II merupakan ras BLB yang tidak virulen. Sedangkan kelompok III merupakan kelompok ras dan haplotipe yang bersifat virulen.
Tidak ada salinan data
Tidak tersedia versi lain